PROF. DR. BAGDY GYÖRGY |
|
|
|||||
Semmelweis Egyetem, Gyógyszerhatástani Intézet, Neuropszichofarmakológiai Kutatócsoport, Budapest |
|||||||
DR. BÁLINT BÁLINT LÁSZLÓ |
|
|
|||||
Debreceni Egyetem, Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet, vendégkutató, Debrecen Kutatási terület: Epigenetika, funkcionális genomika Az epigenetikai öröklődés fizikai hordozói a kromatin szintjén módosítják a gének kifejeződését. Kutatásaim célja megismerni és kiaknázni a génexpresszió kromatin szintű szabályozásának folyamatait az onkológiai kórképek kialakulásában és kezelésében. Ebből a célból a génexpresszió szabályozásában kritikus elemek jelentőségét vizsgálom daganatos sejtekben és izogenikus sejtekben. Célom a rendelkezésre álló adatok multiomikai integrálása és ezáltal a kritikus génexpressziót szabályozó elemek azonosítása. ELIXIR részvétel: Oktatási koordinátor
|
|||||||
DR. BARTA ENDRE |
|
|
|||||
Magyar Agrár- és Élettudományi Egyetem, Genetika és Biotechnológia Intézet, Debreceni Egyetem, Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet, Kutatási területek: mezőgazdasági genomika, génszabályozás, funkcionális genomika, bioinformatika Gödöllői munkacsoportomban elsősorban a háziállatok genomikájával foglalkozunk. Korábban meghatároztuk, elemeztük a hazai mangalica fajták genomjait. Elsőként Magyarországon denovo összeraktuk egy emlősállat, a gímszarvas teljes referencia genomszekvenciáját. Populáció genomikai módszerekkel vizsgáljuk a házi- és üregi nyulakat. Az Európai Referencia Genom Atlasz (ERGA) pilot projekt keretében összerakjuk az aranysakál referencia genomját. Debreceni egyetemi csoportommal a génszabályozást vizsgáljuk genomszinten, Big Data bioinformatikai módszerekkel. Nagy mennyiségben dolgozunk fel publikus ChIP-seq adatokat. Eredményeinket a ChIPSummitDB adatbázisban gyűjtjük. Az adatokból próbáljuk megállapítani, hogy az egyes fehérjék hol, milyen sorrendben, és miért kötődnek pont ott a DNS-en. Az Elixir-en belül alapító tagja vagyok a Biodiverzitás közösségnek. ELIXIR részvétel: Technikai koordinátor Biodiversity Community |
|||||||
PROF. DR. BARTA ZOLTÁN |
|
|
|||||
Debreceni Egyetem, TTK Evolúciós Állattani és Humánbiológiai Tanszék, Debrecen Kutatási területek: (1) utódgondozás genetikai hátterének vizsgálata bogarakban; és (2) természetvédelmi adatok ökoinformatikai elemzése. (1) A korai, idilli nézettel szemben az utódgondozás során a szülők között jelentős érdekellentétek feszülnek, melyek feloldása nem triviális. Kutatásaink során korábbi elméleti vizsgálatainkra támaszkodva genomikai, transzkriptomikai módszerekkel próbáljuk feltárni ezen ellentét megoldását segítő mechanizmusokat egy új bogármodellrendszerben, a nagyfejű csajkóban. (2) A természetvédelem működése során hatalmas mennyiségű térben referált biotikai adat keletkezik, mely feldolgozása, nem beszélve annak értelmezéséről, nem megoldott. Vizsgálataink során modern adatbányászmódszereket alkalmazva próbáljuk felmérni ezen adathalmaz prediktív alkalmazásának lehetőségét. |
|||||||
PROF. DR. BÖDÖR CSABA |
|
|
|||||
Semmelweis Egyetem, Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet Budapest, HCEMM-SE Molekuláris Onkohematológia Kutatócsoport, Budapest Kutatási területek: molekuláris onkohematológia, daganatgenomika A Molekuláris Onkohematológia Kutatócsoport (Semmelweis Egyetem, Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet) különböző lymphomák és leukémiák esetében végez genomikai és transzkriptomikai kutatásokat, valamint diagnosztikus fejlesztéseket a legkorszerűbb újgenerációs szekvenálási és bioinformatikai eljárások alkalmazásával. A kutatások célja a betegségek lefolyásával és különböző célzott terápiákra adott válaszkészséggel kapcsolatba hozható biomarkerek azonosítása, valamint a terápiák szelekciós nyomásának hatására kialakuló klonális evolúció időbeli és térbeli aspektusainak feltérképezése. |
|||||||
PROF. DR. CSABAI ISTVÁN |
|
|
|||||
Eötvös Loránd Tudományegyetem, TTK Fizikai Intézet, Budapest Kutatási területek: genomika, BigData, mesterséges intelligencia Csoportunk kutatásainak középpontjában az adatintenzív bioinformatikai kutatások állnak. Számos hazai és európai projekt keretében részt veszünk rákgenetikai vizsgálatokban, környezeti minták metagenomikai elemzésében, molekuláris öregedéskutatásban, járvány-genetikai vizsgálatokban. Munkánk során az élenjáró bioinformatikai elemző szoftverek mellett nagymértékben használjuk a modern gépi tanulás eredményeit is, és arra törekszünk, hogy az alapkutatási eredmények minél hamarabb hasznosuljanak az egészségügyi gyakorlatban. ELIXIR részvétel: Platforms, BY-COVID |
|||||||
PROF. DR. CSIKÁSZ-NAGY ATTILA |
|
|
|||||
Pázmány Péter Katolikus Egyetem, Információs Technológiai és Bionikai Kar |
|||||||
PROF. DR. CSŐSZ ÉVA |
|
|
|||||
Debreceni Egyetem |
|||||||
DR. DOSZTÁNYI ZSUZSANNA |
|
|
|||||
Eötvös Loránd Tudományegyetem, TTK Biokémia Tanszék, Budapest Kutatási területek: fehérje szekvencia predikció, gépi tanulás, rendezetlen fehérjék, fehérje-fehérje kölcsönhatás 2014-től vezetem az MTA Lendület pályázat támogatásával megalakult Bioinformatikai Kutatócsoportot az ELTE TTK Biokémia Tanszékén. Fő kutatási területünk az eredendően rendezetlen fehérjék bioinformatikai és mélytanulásos módszerekkel. Ehhez kapcsolódóan fejlesztünk különböző predikciós módszereket, végzünk számítógépes biológiai vizsgálatokat, illetve közreműködünk különböző adatbázisok kifejlesztésében is. Célunk az, hogy megérthessük azt, hogy hogyan képesek a rendezetlen fehérjék alapvetően fontos biológiai funkciójukat ellátni, mutációjuk hogyan vezet különböző betegségekhez, például rákhoz, illetve neurodegeneratív betegségekhez, illetve hogy lehet ezeket a fehérjéket felhasználni újfajta gyógyszermolekulák tervezéséhez. Aktívan részt veszünk az ELIXIR Intrinsically Disordered Proteins közösségében annak érdekében, hogy az ELIXIR céljaival összhangban jobban láthatóvá, elérhetővé, átjárhatóvá tegyük a különböző, fehérje rendezetlenséghez kapcsolódó eszközöket. ELIXIR Community részvétel: Intrinsically Disordered Protein, Training Platform |
|||||||
DR. FEKETE JÁNOS TIBOR |
|
|
|||||
Semmelweis Egyetem, Bioinformatika Tanszék, Budapest Kutatási terület: transzkriptom alapú prediktív biomarkerek szolid tumorokban A kutatásaim fókuszában a prediktív biomarkerek állnak. A három éve indult ROC Plotter projekt célja az, hogy egy webalkalmazáson keresztül, az adatokat egységes szerkezetben kezelve összefüggéseket keressünk az egyes gének expressziója és a terápiás válasz között. Az alkalmazás emlő-, méhnyak-, kolorektális tumor, valamint glioblasztomás betegek génchip és újgenerációs RNS méréseken alapuló forrásadatait használja. Az alkalmazás segítségével lehetőséget kívántunk biztosítani arra, hogy kísérletes eredmények független, külső validációját biztosítsuk a kutatóközösség számára. A honlap (www.rocplot.org) további szolgáltatása, hogy saját adatokból is lehetséges ROC analízis elvégzése, így további statisztikai szoftverek felhasználása nélkül is lehetséges kísérletes eredmények gyors kiértékelése. ELIXIR részvétel: GALAXY Platform |
|||||||
DR. GARAMSZEGI LÁSZLÓ ZSOLT |
|
|
|||||
Ökológiai Kutatóközpont, Ökológiai és Botanikai Intézet, Budapest Kutatócsoport: Evolúciós Ökológia Kutatócsoport Kutatási területek: (1) klímaváltozás és (újonnan) felbukkanó betegségek-citizen science: www.szunyogmonitor.hu ; (2) akusztikus kommunikáció és a kulturális evolúció A társadalom széles körű bevonásával és innovatív technológiák (pl. mobilapplikációk) segítségével gyűjtünk nagymennyiségű adatot az ország minden pontjáról, majd kifinomult bioinformatikai, gépi tanulási módszereket alkalmazva nyerünk folyamatos információt az újonnan megjelenő kórokozók aktuális elterjedéséről. Az örvös légykapó modellfajon gyűjtünk hosszú távú adatokat annak érdekében, hogy megértsük a madárének ivari kiválasztódásban betöltött szerepét és a populáció szintjén térben és időben megmutatkozó dinamizmusokat. |
|||||||
DR. GÁSPÁRI ZOLTÁN |
|
|
|||||
Pázmány Péter Katolikus Egyetem, Budapest A kísérletes vizsgálatok mellett kiemelten foglalkozunk a fehérjék belső dinamikáját tükröző fehérjeszerkezeti sokaságok előállításával és elemzésével, elsősorban NMR-spektroszkópiai adatokra támaszkodva, valamint egyes fibrilláris szerkezeti motívumok vizsgálatával. Funkcionális oldalról fő érdeklődési területünk a szinaptikus jelátvitelben részt vevő, elsősorban a posztszinaptikus denzitás felépítésében szerepet játszó egyes fehérjék szerkezeti-dinamikai vizsgálata, illetve kölcsönhatásaik modellezése. |
|||||||
DR. GYENESEI ATTILA |
|
|
|||||
Pécsi Tudományegyetem Szentágothai János Kutatóközpont, Pécs A vezetésem alatt álló Bioinformatikai kutatócsoport és a korszerű műszerezettséggel és szakembergárdával működő Genomika és Bioinformatika Core Facility kutatásainak középpontjában egyrészt a biotechnológia területén végbemenő fejlődés nyújtotta lehetőségek kiaknázása, másrészt ennek egyik fő következménye, az eddig soha nem látott mennyiségben és részletességben rendelkezésre álló biológiai és orvosi adatmennyiség elemzése áll. A két terület gyakorlati összekapcsolása és korszerű bioinformatikai módszerek alkalmazása lehetőséget nyújt a molekuláris szintű biológiai folyamatok jobb megértésében és ezen biológiai ismeretek alkalmazásában az orvoslásban, az iparban és a mezőgazdaságban. Mindezek mellett kiemelt célunk kezdettől a bioinformatika és biostatisztika előmozdítása a Pécsi Tudományegyetemen, az itt dolgozó kutatócsoportok segítése, valamint kutatói és infrastrukturális pályázatokban való aktív részvétel. Reményeink szerint ezzel lehetővé válik a kutatásokból származó nagy tömegű adatok, információk feldolgozása, elemzése, továbbá növekedhet a kutatási aktivitás, a kollaborációk száma, nő a pályázatokban való részvételi lehetőség. Mindezek mellett a különböző genetikai és klinikai multi- faktoriális betegségek jellemzésével és biomarker-elemzéssel foglalkozunk, elsősorban hipotézisfüggetlen, adatbányászat- és mesterséges intelligencián alapuló eljárások alkalmazásával és fejlesztésével. ELIXIR részvétel: technikai koordinátor |
|||||||
PROF. DR. GYŐRFFY BALÁZS |
|
|
|||||
Természettudományi Kutatóközpont |
|||||||
PROF. DR. HARRACH BALÁZS |
|
|
|||||
Állatorvostudományi Kutatóintézet, Molekuláris Virológia témacsoport Budapest Kutatási területek: házi és vadállatok vírusai, vírusgenetika, filogenetikai számítások, vírustaxonómia Kutatócsoportunk vizsgálja a gazdasági, kedvenc és vadállatok vírusainak diverzitását, genomját, biológiáját, törzsfejlődését és kimutatási lehetőségüket. Következtetünk a gazdák és vírusaik koevolúciójára, a korábbi gazdaváltásokra, kutatjuk a vadon élő állatok (pl. denevérek, majmok) potenciálisan embert és háziállatokat fertőző vírusait. A vadállatmintákat Dél-Amerikától Új-Zélandig terjedően küldik. Eredményeinket a Nemzetközi Vírusrendszertani Bizottságban végzett munkában fordítjuk hivatalos taxonómiává. |
|||||||
PROF. DR. HORVÁTH PÉTER |
|
|
|||||
Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Biokémiai Intézet, Szeged Főállásban a Szegedi Biológiai Kutatóközpont Biokémiai Intézetének igazgatója vagyok, valamint a Helsinki Egyetemen működő FIMM-ben (Finnish Institute for Molecular Medicine) kutatócsoport-vezető, Finland distinguished professor és a High-content analysis egység igazgatója. A Szegedi Tudományegyetemen szereztem programtervező matematikus diplomát (2003), majd a Nizzai Egyetemen PhD fokozatot (2007), amely során az INRIA-n műholdkép-feldolgozó alkalmazásokat fejlesztett. A PhD-fokozat elnyerése után 7 évig a Zürichi Műszaki Egyetemen (ETH, Eidgenossische Technische Hochschule) dolgoztam docensként, a számítógépes sejtbiológiai kutatások területén. Hét éve tértem haza, a Szegedi Biológiai Kutatóközpont Biokémiai Intézetébe, és ugyanekkor kezdtem párhuzamosan dolgozni a FIMM-ben. Az elmúlt években megalapítottam a szegedi és a helsinki-beli BIOMAG kutatócsoportokat, amelyekben együttesen mintegy 30 fő dolgozik. Kutatócsoportjaink sejtek nagy felbontású térbeli vizsgálatára alkalmas, általuk kifejlesztett rendszermikroszkópia segítségével biológiai problémákra adnak számítógépes algoritmusokkal támogatott megoldást. Eredményeinket a legmagasabb tudományos fórumokon közlik (Nature Methods, Nature Communications, NRDD, Science, stb.). Kutatásainkkal a COVID-19-betegség elleni harcban is aktívan részt veszünk. |
|||||||
DR. KENESSEY ISTVÁN |
|
|
|||||
Országos Onkológiai Intézet, Budapest A Nemzeti Rákregiszter és Biostatisztikai Központ a hazai daganatos betegek adatait gyűjti és dolgozza fel. Célunk amellett, hogy adatokat szolgáltassunk az onkológiai betegségek epidemiológiai helyzetéről, visszajelzést adjunk az egészség- ügyi ellátóknak és a Nemzeti Egészségbiztosítási Alapkezelőnek valamint az Emberi Erőforrások Minisztériumának, hozzájárulva az ellátás minőségbiztosításához, illetve az onkológiai hálózat fejlesztéséhez. Szorosabb kutatási területünket képezi a daganatos epidemiológiai helyzet változása és a trendek leírása, illetve az egyes betegségek túlélésében történő változás és ennek hátterében lévő okok feltárása. |
|||||||
DR. KÓS PÉTER |
|
|
|||||
Szegedi Tudományegyetem SZTE Biotechnológiai Tanszék, Szeged A Szegedi Tudományegyetem Természettudományi Karán Dr. Rákhely Gábor 2000 körül alapította meg a bioinformatika oktatást tantárgyi keretek között. Az egy-egy féléves elméleti és gyakorlati oktatást az évek során molekuláris evolúcióval, omikai tudományokkal és informatikai jellegű tantárgyakkal kiegészítve elindítottuk egy bioinformatikai szakirány kialakítását a biológus hallgatók számára, aminek fejlesztése jelenleg is zajlik. Az ország különböző egyetemein folyó bioinformatikai oktatással való harmonizáció, valamint ezen műhelyekkel való kollaboráció érdekében csatlakoztunk az ELIXIR Magyarország node-hoz. Az Egyetemen jelentős bioinformatikai kutatás, és erre szolgáló központi intézmény nincsen; az újgenerációs szekvenálással támogatott humán molekuláris diagnosztika, a mikrobiális genetika, környezeti és orvosi metagenomika stb. tárgyában végzett kutatások és szolgáltatások részeként, azokat segítve alkalmazzuk a bioinformatikai módszereket, egyrészt külön hw/sw megoldásokkal, másrészt az SZBK mesterséges intelligenciát ill. omikákat kutató egységeivel együttműködésben. Az ELIXIR-hez és más nemzetközi konzorciumokhoz való csatlakozással jelenleg azon fáradozunk, hogy kialakítsuk Szegeden a bioinfiormatikai módszerek kutatásának, oktatásának és felhasználásának egy koherensebb, hatékonyabb és modernebb rendszerét. |
|||||||
DR. LIGETI BALÁZS |
|
|
|||||
Pázmány Péter Katolikus Egyetem, Információs Technológiai és Bionikai Kar, Budapest Kutatási terület: Kutatási terület: Neurális Bioinformatika, mikrobiom, genomikai-nyelvmodellek Kutatócsoportunk fókuszában a nagyméretű genomikai nyelvmodellek és szekvencia-reprezentációk állnak. Az egyik alapvető kulcskérdés a kvantitatív biológiában, hogy hogyan tudunk új mintázatokat és struktúrákat megismerni: ez alapvető feltétele annak, hogy hatékonyan modellezhessük a komplex rendszereket, előrejelezhessük viselkedésüket, illetve manipulálhassuk azokat. A mikroorganizmusok létfontosságú szerepet játszanak az élet fenntartásában a Földön a hatalmas metabolikus képességeikkel; így működésük megértése különösen fontos olyan problémák kezelésében, mint az antimikrobiális rezisztencia, az éghajlatváltozás és az újfajta patogének megjelenése. A csoport célja olyan újfajta neurális és pángenomikai reprezentációk és ezekre épülő interpretálható algoritmusok kidolgozása mikroorganizmusokhoz köthető feladatokra, amelyek képesek a gyorsan növekvő, heterogén adatmennyiséggel lépést tartani; ezt képesek hatékonyan elemezni, mintázatokat azonosítani; valamint robosztusak az olyan problémákkal szemben, mint a kontextusfüggőség, vagy az elérhető címkézett adatok hiánya. |
|||||||
DR. MENYHART OTILIA |
|
|
|||||
Semmelweis Egyetem, Bioinformatika Tanszék, Budapest |
|||||||
Kutatási terület: Diagnosztikai eszközök fejlesztése betegektől származó mérések adatainak felhasználásával A különféle tesztek, klinikai vizsgálatok során hatalmas, akár több száz paramétert tartalmazó heterogén adathalmaz keletkezik minden páciensről, melyekből következtetni lehet a klinikai kimenetre és a betegek túlélésére. Ezen adatok értelmezése azonban méretükből kifolyólag nem rutinfeladat. A megfelelő bioinformatikai eszközök azonban lehetővé teszik ezen adatok diagnosztikai illetve prognosztikai célú kiaknázását. A kutatás során elsősorban az onkológia területén végzünk mesterséges intelligencia alapú vizsgálatokat betegekből származó mérések adataira támaszkodva. A téma elsősorban a bioinformatika és a klinikai kutatás iránt érdeklődő hallgatók számára lehet érdekes. |
|||||||
DR. MIKLÓS DEZSŐ |
|
|
|||||
Rényi Alfréd Matematikai Kutató Intézet, Budapest Kutatási területek: extremiális kombinatorikai módszerek a bioinformatikában A Magyar Bioinformatikai Társaság egyik alapítója, sok éven át alelnöke voltam. Fő kutatási területem a bioinformatikai problémákban előforduló extremiális mintázatok keresése. Foglalkozom hálózatelemzésekkel, periodikus mintázatok keresésével.
|
|||||||
DR. MIKLÓS ISTVÁN |
|
|
|||||
Rényi Alfréd Matematikai Kutató Intézet, Budapest Kutatási területek: sztochasztikus modellek, Markov-lánc Monte-Carlo-metódusok, genomátrendeződési modellek. Fő kutatási területünk a hatékony Markov-lánc Monte-Carlo-metódusok és a molekuláris evolúció sztochasztikus modellezése. A ClcBio (pár éve felvásárolta a Quiagen) vezetésével egy FP7-es project keretében evolúciós rejtett Markov-model- lek segítségével transzkripciós faktor kötőhelyeket prediktáló szoftvert fejlesztett. Társszervezője voltam a 2009-es RECOMB Comparative Genomics konferenciának, valamint két, bioinformatikai témákkal is foglalkozó Dagstuhl-szemináriumnak. |
|||||||
DR. MONOSTORY KATALIN |
|
|
|||||
Természettudományi Kutatóközpont |
|||||||
DR. NAGY ATTILA CSABA |
|
|
|||||
Debreceni Egyetem, Egészségtudományi Kar, Egészségtudományi Intézet, Egészségügyi Informatikai Tanszék. Epidemiológiai és Bioinformatikai Munkacsoport, Debrecen Kutatási területe: Biostatisztika, Epidemiológia, BigData Munkacsoportunk népegészségügyi jelentőséggel bíró megbetegedések adatbázisainak biostatisztikai feldolgozásával és értékelésével foglalkozik. Az összefüggések feltárása mellett a nagy mennyiségű értékes strukturálatlan adat hasznosításával, szabad szöveges adatokból értékes információ kinyerésével foglalkozunk. |
|||||||
PROF. DR. PATTHY LÁSZLÓ |
|
|
|||||
Természettudományi Kutatóközpont Molekuláris Élettudományi Intézet, Budapest Kutatási területek: genom evolúció, fehérje evolúció, funkcionális genomika, bioinformatika Az általam vezetett csoport elsősorban genomevolúcióval, genomannotációval, a fehérjekódoló gének szerkezetének és a fehérjék funkciójának predikciójával foglalkozik. A bioinformatikai munkák mellett néhány, általunk azonosított, orvos- biológiai szempontból fontos fehérje (pl. az izomfejlődés szabályozásában szerepet játszó WFIKKN1 és WFIKKN2 fehérjék) szerkezetét és funkcióját is vizsgáljuk kísérletes módszerekkel. |
|||||||
PROF. DR. PONGOR SÁNDOR |
|
|
|||||
Pázmány Péter Katolikus Egyetem (PPKE), Budapest Kutatási területek: sejtek közötti kommunikáció genomikája, ágens alapú modellek, rendszerbiológia Kutatócsoportom érdeklődése a baktériumközösségek bioinformatikai leírása, stabilitásuk kritériumai, melyet egyrészt a genomszekvenciák összehasonlító analízisével, másrészt a közösségek ágens alapú modellezésével közelítünk meg. Tágabb érdeklődésünk a rendszerelméletre alapozott molekuláris ismeretábrázolás és annak felhasználása a bioinformatika, a rendszerbiológia és a biológiai adattudományok oktatásában. Jelenleg a Magyar Bioinformatikai Társaság illetve MTA Bioinformatikai Osztályközi Tudományos Bizottságának elnöke vagyok és a PPKE ITK Roska Tamás Doktori Iskola biológiai PhD programjának vezetője. Jelenleg tagja vagyok az Academia Europaeának és a Magyar Tudományos Akadémiának, illetve, szerkesztőbizottsági tagja a Briefings in Bioinformatics, a Database, és a Scientific Reports folyóiratoknak. |
|||||||
PROF. DR. SIMON ISTVÁN |
|
|
|||||
Természettudományi Kutatóközpont |
|||||||
DR. SOLYMOSI NORBERT |
|
|
|||||
Állatorvostudományi Egyetem Bioinformatikai Központ, Budapest Kutatási területek: epidemiológia, genomika A Bioinformatikai Központ az Állatorvostudományi Egyetemen elsősorban a mikrobiális genomika oktatása céljából jött létre. Ehhez kapcsolódóan több fertőző állatbetegség (pl. afrikai sertéspestis, PRRS) országos mentesítési programjában végzünk genomikai elemzéseket, valós idejű kockázatbecslést. Saját vizsgálatainkban központi témakör a klinikai meta- genomika, ezen belül a mikrobiommal és rezisztómmal kapcsolatos kutatások. Hazai és külföldi együttműködésekben transzkriptomikai, epigenetikai adatelemzésekkel veszünk részt. utatási területek: epidemiológia, genomika. |
|||||||
DR. SRAMKÓ GÁBOR |
|
|
|||||
Debreceni Egyetem, Debrecen |
|||||||
DR. SZÁSZ ATTILA MARCELL |
|
|
|||||
Semmelweis Egyetem, Bioinformatikai Tanszék, Budapest Kutatási terület: szolid tumorok, különösen a malignus melanoma és emlőrák, ezekben a tumor-host kölcsönhatások vizsgálata az immunreakciók tükrében. Kutatási megközelítésünkben erős klinikai alapokon, szöveti morfológiai tulajdonságokra építkezve elemezzük DNS, RNS és protein szinten detektálható adatok kapcsolatait, heterogenitását térben és időben az adott betegek esetében. Fókuszunk a betegeken belüli változatosság feltárása, olyan faktorok azonosítása, amely a tumoros folyamatok jobb megértéséhez vezet, diagnosztikus és terápiás fejlesztéseket is magában rejt. ELIXIR Community részvétel: Proteomics részvétel a European Cancer Moonshot Programban |
|||||||
PROF. DR. SZÉLL MÁRTA |
|
|
|||||
Szegedi Tudományegyetem. Orvosi Genetikai Intézet és Szent-Györgyi Albert Klinikai Központ, Szeged Az Intézet vezetőjeként elsősorban klinikai genetikai diagnosztikai tevékenységet és az ahhoz kapcsolódó kutatásokat irányítom. Kutatási tevékenységünk egyes ritka betegség kórkép csoportokra fókuszál, úgy mint a ritka, genetikailag meghatározott bőrbetegségek - genodermatózisok -, valamint neurogenetikai kórképek. Kutatási tevékenységünk elsősorban genotípus-fenotípus összefüggések feltárására, valamint újonnan azonosított genetikai variánsok funkcionális vizsgálatára irányul. Az elmúlt évek egyik kiemelt jelentőségű kutatási projektjében a Pécsi Tudományegyetem kollégáival együttműködésben a COVID-19 betegség lefolyását meghatározó és/vagy befolyásoló genetikai variánsok azonosításán dolgozunk. |
|||||||
PROF. DR. THAN NÁNDOR GÁBOR |
|
|
|||||
Természettudományi Kutatóközpont |
|||||||
PROF. DR. TŐZSÉR JÓZSEF |
|
|
|||||
Debreceni Egyetem Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet, Debrecen Kutatási területek: retrovirális biokémia, virális proteóm, virális fertőzés hatása a celluláris proteómra és transzkriptómra, fermentlevek, tej omikai elemzése. Az általam vezetett Retrovirális Biokémiai Kutató Laboratórium legfőbb kutatási területét a vírusok életciklusának tanulmányozása képezi. A virális és az azokkal rokon eukarióta fehérjék szerkezet-funkció összefüggéseinek in vitro vizsgálata mellett szerkezeti biológiai és elméleti kémiai megközelítéseket is alkalmazunk. Célunk a vírusfertőzések (pl. HIV és SARS-CoV-2) korai fázisában a gazdasejtekben bekövetkező proteomikai és transzkriptomikai változások tanulmányozása is. A vírus-gazdasejt kölcsönhatási hálózatok feltérképezése céljából omikai módszerekkel nyert adatok elemzése statisztikai és bioinformatikai módszerekkel történik. Emellett munkánkban fontos szerepet kapnak az élelmiszeripari alkalmazás szempontjából jelentős kutatások is, részt veszünk különböző borok és borecetek metabolomikai analízissel azonosított komponenseinek bio- és kémiai-informatikai módszerekkel történő elemzésében, valamint tejalapú funkcionális élelmiszer kifejlesztését célzó kutatás-fejlesztési együttműködés keretében proteomikai és transzkriptomikai analíziseket és bioinformatikai módszerekkel történő adatelemzést is végzünk. |
|||||||
DR. TUSNÁDY GÁBOR |
|
|
|||||
Természettudományi Kutatóközpont, Molekuláris Élettudományi Intézet, Budapest ELIXIR Community részvétel: 3D BioInfo |