Adatbázis-szolgáltatások

Acronym: HTP

Név: Emberi transzmembrán proteóm adatbázisa

Webcím: http://htp.enzim.hu

Referencia: Dobson L, Reményi I, Tusnády GE. The human transmembrane proteome. Biol Direct. 2015;10:31.

(idézve: 63x)

Acronym: PDBTM

Név: Meghatározott térszerkezettel rendelkező transzmembrán fehérjék membrán lokalizációjának adatbázisa

Webcím: http://pdbtm.enzim.hu

Referencia: Kozma D, Simon I, Tusnády GE. PDBTM: Protein Data Bank of transmembrane proteins after 8 years. Nucleic Acids Res. 2013;41(Database issue):D524-9.

(idézve: 400x)

Acronym: PolarProtDb

Név: Polarizált sejtekben levő transzmembrán fehérjék lokalizációjának és poszt-transzlációs módosulásainak adatbázisa

Webcím: http://polarprotdb.ttk.hu/

Referencia: Zeke A, Dobson L, Szekeres LI, Langó T, Tusnády GE. PolarProtDb: A Database of Transmembrane and Secreted Proteins showing Apical-Basal Polarity. J Mol Biol. 2021;433(11):166705.

Acronym:TmAlphaFold

Név: AlphaFold2 eljárás által becsült transzmembránfehérje szerkezetek membrán-lokalizációjának adatbázisa

Webcím: https://tmalphafold.ttk.hu/

Referencia: Dobson L, Szekeres LI, Gerdán C, Langó T, Zeke A, Tusnády GE. TmAlphaFold database: membrane localization and evaluation of AlphaFold2 predicted alpha-helical transmembrane protein structures. Nucleic Acids Res. 2023 Jan 6;51(D1):D517-D522.

Acronym: ChIPSummitDB 

Név: A ChIPSummitDB a humán ChIP-seq kísérletekkel igazolt transzkripciós faktor kötőhelyek átfogó adatbázisa.

Webcím: https://summit.med.unideb.hu/summitdb/

Referencia: Erik Czipa, Mátyás Schiller, Tibor Nagy, Levente Kontra, László Steiner, Júlia Koller, Orsolya Pálné-Szén, Endre Barta, ChIPSummitDB: a ChIP-seq-based database of human transcription factor binding sites and the topological arrangements of the proteins bound to them, Database, Volume 2020, 2020, baz141

Acronym: TOPDB

Név: Transzmembrán fehérjék kísérleti úton meghatározott topológiai adatainak adatbázisa

Webcím: http://topdb.enzim.hu

Referencia: Dobson L, Langó T, Reményi I, Tusnády GE. Expediting topology data gathering for the TOPDB database. Nucleic Acids Res. 2015, 3(Database issue):D283-9.

(idézve: 100x)

Acronym: TFLink

Név: Transzkripciós faktor - célgén interakciós és kötőhely adatbázis több fajra

Webcím: https://tflink.net/

Referencia: Liska O, Bohár B, Hidas A, Korcsmáros T, Papp B, Fazekas D, Ari E. TFLink: an integrated gateway to access transcription factor-target gene interactions for multiple species. Database (Oxford). 2022:baac083.

Acronym: TSTMP

Név: Legfontosabb transzmembrán célfehérjék adatbázisa

Webcím: http://tstmp.enzim.ttk.mta.hu

Referencia: Varga J, Dobson L, Reményi I, Tusnády GE. TSTMP: target selection for structural genomics of human transmembrane proteins. Nucleic Acids Res. 2017;45(D1):D325-D330.

Acronym: NRR, Nemzeti Rákregiszter

Név:, A különböző rákos megbetegedések számait tartalmazza nemi, korcsoportos és terület szerinti bontásban.

Webcím: https://onkol.hu/nemzeti-rakregiszter/

Referencia: Kenessey I, Wéber A, Szilágyi I, Nagy P, Polgár C, Kásler M. Az orvosi kódtárak gyakorlati alkalmazása az onkológiában – szakmai útmutató a Nemzeti Rákregiszter tapasztalatai alapján. Magy Onkol. 2022 Mar 28;66(1):4-10. Hungarian. Epub 2021 Dec 18. PMID: 35343969.

Acronym: MÉTA

Név: A hazai természetes növényzeti örökségünk tudományos értékelésére szolgáló program

Webcím: https://www.novenyzetiterkep.hu/

Referencia: I. Somodi, Z. Molnár,B. Czúcz,Á. -Fazekas, J. Bölöni,L. Pásztor, A. Laborczi,N. E. Zimmermann: Implementation and application of multiple potential natural vegetation models–a case study of Hungary, Journal of Vegatation Science, 2017 - Wiley Online Library

Acronym: DT40

Név: Csirke DT40 sejtvonal genomszekvenciájának adatbázisa

Webcím: http://dt40.enzim.ttk.mta.hu

Referencia: Molnár J, Póti Á, Pipek O, Krzystanek M, Kanu N, Swanton C, Tusnády GE, Szallasi Z, Csabai I, Szüts D. The genome of the chicken DT40 bursal lymphoma cell line. G3 (Bethesda). 2014;  4(11):2231-40.