|
Acronym: CCTOP Név: A transzmembrán fehérjék topológiáját és struktúráját feldolgozó eszközök Webcím: http://cctop.enzim.ttk.mta.hu Referencia: Dobson L, Reményi I, Tusnády GE. CCTOP: a Consensus Constrained TOPology prediction web server. Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1): W408-12. (idézve: 210x) |
|
Acronym: IUPred Név: Rendezetlen fehérje régiók meghatározására szolgáló eszköz Webcím: http://iupred.enzim.hu Referencia: Gábor Erdős, Zsuzsanna Dosztányi: Analyzing Protein Disorder with IUPred2A, Current Protocols in Bioinformatics, 2020. (idézve: 1600) |
|
Acronym: KMPLOT Név: Meta-analízis alapú, tumor biomarker becslésére szolgáló eszköz Webcím: https://kmplot.com/ Referencia: B Győrffy, P Surowiak, J Budczies, A. Lánczky: Online sur-vival analysis software to assess the prognostic value of biomarkers using transcriptomic data in non-small-cell lung cancer, PLoS One, 2013. (idézve: 1470x) |
|
Acronym: IsoMut Név: izogén mintacsoportokban előforduló egyedi mutációk (SNP, deléció, inszerció) meghatározására szolgáló eszköz Webcím: http://www.genomics.hu/tools/isomut/isomut.html Referencia: Pipek, D. Ribli, J. Molnár, Á. Póti, M. Krzystanek, A. Bodor, G. E. Tusnády, Z. Szallasi, I. Csabai & D. Szüts: Fast and accurate mutation detection in whole genome sequences of multiple isogenic samples with IsoMut, BMC Bioinformatics V 18, 2017. |
|
Acronym: ROC plotter Név: génexpresszió alapján prediktív biomarkerek azonosítása és validálása szolid tumorokban Webcím: http://www.rocplot.org Referencia: Fekete JT, Győrffy B. ROCplot.org: Validating predictive biomarkers of chemotherapy/hormonal therapy/anti-HER2 therapy using transcriptomic data of 3,104 breast cancer patients. Int J Cancer. 2019;145 (11):3140-3151. (idézve: 92) |
|
Acronym: BiSearch Név: Primer Design and Search Tool Webcím: http://bisearch.enzim.hu Primer tervező és ePCR-t készítő eljárás biszulfittal kezelt és nem kezelt DNS szekvenciákra (cDNS, genomiális) Referencia: Arányi T, Váradi A, Simon I, Tusnády GE. The BiSearch web server. BMC Bioinformatics. 2006 Oct 5; 7:431. (idézve: 240x) |
|
Acronym: CMWeb Név: Contact Map WebViewer Webcím: http://cmweb.enzim.hu Referencia: Kozma D, Simon I, Tusnády GE. CMWeb: an interactive on-line tool for analysing residue-residue contacts and contact prediction methods. Nucleic Acids Res. 2012 Jul;40(Web Server issue): W329-33. |
|
Acronym: HMMTOP Név: Transzmembrán régiók becslése az aminosav szekvencia alapján Webcím: http://www.enzim.hu/hmmtop Referencia: Referencia: GE Tusnady, I Simon: The HMMTOP transmembrane topology prediction server, Bioinformatics, 2001 - academic.oup.com (idézve: 2777x) |
|
Acronym: MemDis Név: Transzmembrán fehérjékben levő rendezetlen szakaszok becslésére alkalmas eljárás Webcím: http://memdis.ttk.hu Referencia: Dobson L, Tusnády GE. MemDis: Predicting Disordered Regions in Transmembrane Proteins. Int J Mol Sci. 2021;22(22):12270. |
|
Acronym: PolarProtPred
Név: Transzmembrán fehérjék polarizált sejtekben való lokalizációjának becslésére alkalmas eljárás Webcím: http://polarprotpred.ttk.hu Referencia: Dobson L, Zeke A, Tusnády GE. |
|