kép

A Hungarian Centre of Excellence for Molecular Medicine (HCEMM) intézményében megkezdődött egy helyi Galaxy szerverpéldány bevezetése, amely a bioinformatikai és adatelemzési munkafolyamatok hatékonyabb támogatását célozza. A fejlesztés Dr. João Sequeira, a HCEMM Scientific Computing vezetőjének szakmai koordinációjával valósul meg.

A Galaxy egy széles körben alkalmazott, nyílt forráskódú platform a reprodukálható bioinformatikai elemzések és workflow-k futtatására, amely grafikus felületén keresztül a különböző elemzési pipeline-ok egyszerűbb hozzáférését és kezelését teszi lehetővé kutatók számára.

A HCEMM-ben kialakított infrastruktúra közvetlen integrációban működik majd a PULI szerveren futó SLURM ütemezőrendszerrel. Ez lehetővé teszi a nagyobb számítási igényű bioinformatikai pipeline-ok magasabb áteresztőképességű futtatását, miközben hatékony hozzáférést biztosít a rendelkezésre álló HPC-erőforrásokhoz.

A fejlesztés fontos lépést jelent a hazai bioinformatikai infrastruktúra megerősítésében, támogatva a skálázható, reprodukálható és felhasználóbarát adatelemzési környezetek elérhetőségét a kutatói közösség számára.

Az aktuális Galaxy példány már elérhető a következő címen: galaxy.hcemm.eu.